THE MENNIGEN LAB
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Dr. Jan Mennigen - Chercheur principal
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​Notre groupe de recherche s'intéresse principalement à la base mécaniste qui sous-tend les phénotypes métaboliques dans les diverses infraclasses de poissons téléostés. L'accent est actuellement mis sur le rôle des déterminants épigénétiques, en particulier les microARN. Notre objectif est d'utiliser les résultats de la recherche fondamentale dans trois domaines pertinents pour la traduction. Il s'agit premièrement de comprendre les contraintes moléculaires de l'utilisation des éléments nutritifs dans les espèces piscicoles, deuxièmement, d'étudier les conséquences écotoxicologiques de la perturbation métabolique induite par les contaminants aquatiques chez les poissons téléostés, et troisièmement, d'utiliser des modèles de poissons pertinents pour rester une maladie métabolique humaine.
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​Curriculum vitae

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Becky Clark - Étudiante au doctorat 2019-présent

Dans mon doctorat, j'étudie les effets  intra-, inter- et transgénérationnels des contaminants persistants et émergents sur les paramètres immunitaires et métaboliques. Je suis également intéressé par l'étude d'un éventuel 'crosstalk' entre les deux systèmes en utilisant des modèles de truites arc-en-ciel et de poissons zèbres. En plus d'utiliser des approches in vivo, je développe des approches de culture de cellules de poissons in vitro pour compléter les études in vivo d'une part, et pour dissocier le rôle des mécanismes moléculaires (et des microARN en particulier) dans les effets immunotoxiques et/ou métaboliques des contaminants.

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​Mais Jubouri - Étudiante au maitrise 2019-présent
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Dans mon projet de maîtrise co-encadré par les Drs Mennigen et Weber, j'étudie l'hypothèse selon laquelle les interactions des nutriments jouent un rôle dans le phénotype intolérant au glucose de la truite arc-en-ciel. Plus précisément, je combine des approches à l'échelle de l'organisme pour étudier le rôle des AA infusés spécifiques sur les flux de glucose chez la truite arc-en-ciel avec la signalisation cellulaire et les paramètres d'expression génétique moléculaire afin de déterminer de façon intégrée le rôle des AA spécifiques sur le métabolisme du glucose chez la truite arc-en-ciel.

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Tyler Eng - Étudiant de 4e année 2019-présent

Je participe à un projet de collaboration dirigé par Environnement et Changements climatiques Canada qui explore les conséquences métaboliques de l'exposition au BDE-47 et aux nano-plastiques dans le modèle du poisson zèbre.  En plus d'utiliser des approches d'expression génique aiguë chez les poissons zèbres adultes pour déterminer si les nanoplastiques modifient l'absorption et l'activité biologique du BDE-47 dans différents tissus, je vais étudier les effets métaboliques potentiels chez les descendants dont les parents ont été exposés au BDE-47 pendant leur développement, leur cycle de vie ou avant la reproduction.

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Jordan Corcoran - Étudiant de 4e année 2019-présent

Dans mon projet, j'étudie le rôle du fond génétique de différentes souches de poissons zèbres (TU, AB, WIK) sur le phénotype métabolique des poissons zèbres et leur réponse à une substance chimique BDE-47 soupçonnée de perturber le métabolisme. À cette fin, j'utilise plusieurs approches au niveau de l'organisme et des tissus pour le phénotype métabolique du poisson zèbre au début de son développement.  


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Bailey Bedard - Étudiante au maitrise 2019-présent
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Travaillant en étroite collaboration avec le ​Dr. Brian Hickey du River Institute, je suis intéressé à étudier le rôle potentiel des habitudes alimentaires (terrestres ou aquatiques) des chauves-souris dans la bioamplification du mercure chez les chauves-souris. De plus, je m'efforce d'étudier l'utilisation potentielle de marqueurs moléculaires (épigénétiques) provenant d'échantillons de follicules pileux peu invasifs pour développer de nouveaux marqueurs potentiels de l'exposition au mercure des chauves-souris.


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Dan Kostyniuk - Étudiant au maitrise 2017-présent
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J'étudie la régulation nutritionnelle et la fonction métabolique des microARN hépatiques chez la truite arc-en-ciel, Oncorhynchus mykiss. Plus précisément, j'utilise des méthodes moléculaires, biochimiques et bioinformatiques in vivo et in vitro pour identifier les microARN régulés par le glucose et pour déterminer si ces miARN jouent un rôle dans l'"intolérance au glucose" chez cette espèce.
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Giancarlo Talarico - Étudiant de 4e année 2019-présent

J'étudie le rôle des acides aminés (en particulier l'alanine et la leucine, qui ont été décrit comme activateurs des senseurs moléculaires d'énergie et des senseurs moléculaires d'acides aminés - AMPK et TOR) sur le flux de glucose chez la truite arc en ciel in vivo. À l'aide d'une technique de double canulation, ces approches compléteront les approches au niveau moléculaire (sélection cellulaire, expression génique et activité enzymatique) pour vérifier l'hypothèse selon laquelle le phénotype " intolérant au glucose " chez la truite arc-en-ciel pourrait être lié à la sélection d'alanine et de leucine dans ce modèle


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Julianne Magnan - Étudiante de 4e année 2019-présent

Dans mon projet, je vise à fournir la première description de la dynamique de méthylation de l'ADN dans le développement précoce de la truite arc-en-ciel. Étant donné la description récente de grandes différences dans la dynamique de méthylation de l'ADN entre les modèles téléostés, illustrées par le poisson zèbre et la médaka, cela fournira des informations de base importantes pour de futures études épigénétiques sur les salmonidés. De plus, je participe à un projet de profilage des effets dépendant du statut social sur l'axe endocrinien somatotrope de la truite arc-en-ciel juvénile.


Mennigen lab alumni

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Dr. Wenqin Tu - Chercheur invité 

Je suis écotoxicologue à l'Académie des sciences du Jiangxi, Nanchang, et je m'intéresse à la toxicité des composés fluorés, que j'étudie dans le modèle du poisson-zèbre en utilisant des approches de laboratoire  et prédictives. Au laboratoire de Dr. Mennigen, j'étudie les effets métaboliques sublétaux des composés fluorés F-53, PFOS et OBS, qui ont été détectés dans les milieux aquatiques chinois.​




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Rubén Martínez López - doctorant visiteur 2017-2019 

Je suis un doctorant invité du laboratoire du Dr Benjami Piña au Centre d'évaluation environnementale et de recherche sur l'eau du Conseil national de recherches d'Espagne à Barcelone, en Espagne. Co-animé par les laboratoires Mennigen et Trudeau, j'utilise le poisson zèbre, Danio rerio comme système modèle pour étudier les perturbateurs endocriniens en utilisant des approches transcriptomiques et métabolomiques. 



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 Adina Gotzmann -  Étudiant de 4e année 2017-2018
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J'étudie la régulation transcriptionnelle nutritionnelle (jeûne/alimentation et injection de glucose) et endocrinienne (injection d'insuline) des gènes métaboliques clés ainsi que les voies de signalisation des cellules d'insuline dans le foie et les muscles de l'aiguillat commun du Pacifique Nord, Squalus suckleyi.
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Jessica Zon - Étudiante de 4e année 2017-2018

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Mon projet, codirigé par les Drs Mennigen et Trudeau, est axé sur l'étude des mécanismes paternels et maternels associés à la modification intergénérationnelle des réactions de stress chez les descendants de poissons zèbres provenant de parents ayant déjà été exposés à la fluoxétine pharmaceutique, un contaminant aquatique dans les systèmes aquatiques urbains. Dans ce projet, je m'intéresse particulièrement à la quantification des transcriptions déposées par voie maternelle qui impliquent la programmation de l'axe des contraintes, ainsi que des transcriptions impliquées dans les voies d'épigénétique moléculaire.​

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Melissa Allaire-Leung - Étudiante de 4e année 2018-19

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Mes projets de recherche portent sur la détermination des conséquences métaboliques de l'exposition au bisphénol-A (BPA), un perturbateur endocrinien, à des concentrations pertinentes pour l'environnement dans le modèle du poisson zèbre. Je cherche à déterminer si l'exposition à court terme au cours d'une période clé du développement entraîne des effets aigus ou à long terme sur le phénotype métabolique des larves et des poissons adultes. Nous avons jugé important d'utiliser EE2 comme témoin positif tout au long de cette étude, afin de déterminer si les effets métaboliques du BPA sont médiés par les composés oestrogéniques.

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Alexandria Trahan - Étudiante de 4e année 2018-2019

J'étudie les effets métaboliques aigus et à long terme de l'exposition embryonnaire au plastifiant DEHP, un perturbateur endocrinien connu, chez le poisson zèbre. Ma thèse vise à déterminer si le DEHP agit comme un perturbateur métabolique de façon aiguë chez les larves et/ou s'il programme des trajectoires de développement vers un phénotype métabolique altéré chez les poissons zèbres adultes. Un aspect secondaire de mon projet consiste à déterminer si les effets métaboliques possibles peuvent être liés à un mode d'action anti-androgénique, que je teste en utilisant le flutamide comme contrôle anti-androgénique positif. 

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Dr. Lucie Marandel - Chercheur invité 

Je suis chef d'un groupe de recherche  à l'INRA NuMeA, où mon groupe étudie le rôle des paralogiques des enzymes impliqué dans la gluconéogénèse chez la truite arc-en-ciel. J'utilise également le profilage épigénétique ciblé pour étudier les contributions potentielles de la méthylation de l'ADN et des modifications de l'histone dans le métabolisme du glucose chez la truite arc-en-ciel et comme outil pour étudier la faisabilité des approches de programmation nutritionnelle chez la truite arc-en-ciel. Un développement récent dans ma recherche est la détermination des effets de la programmation nutritionnelle spécifique au sexe chez la progéniture.
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Zeinab Altmieme - Étudiante au maitrise 2017-2019

Je m'intéresse au rôle des nonapeptides dans le comportement reproducteur des cyprinidés mâles. J'utilise le modèle du poisson zèbre, Danio rerio, pour étudier l'implication des neuropeptides isotocine et vasotocine dans le comportement reproducteur, l'axe endocrinien reproducteur et le succès du frai. À cette fin, j'utilise des approches immunohistochimiques et pharmacologiques pour étudier les paramètres comportementaux, moléculaires et endocriniens de la reproduction. Ces travaux ont également des répercussions sur les travaux d'écotoxicologie portant sur les cibles non apeptidiques des perturbateurs endocriniens chez les poissons téléostés.

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Rida Haider - Étudiant de 4e année 2017-2018
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J'étudie le rôle possible de l'isotocine comme médiateur des paramètres de reproduction en réponse à la signalisation des phéromones chez le poisson rouge mâle, Carassius auratus. Je m'intéresse en outre à l'étude du rôle du contexte social sur la stimulation de l'axe reproductif masculin chez la même espèce.
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Majd Haddad - Étudiant de 4e année 2017-2018
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​Mon projet, codirigé par les Drs Mennigen et Trudeau, est axé sur l'étude de l'hérédité paternelle et maternelle de la réponse au stress chez les poissons zèbres exposés à la fluoxétine pharmaceutique, un contaminant aquatique dans les systèmes aquatiques urbains. Dans le cadre de ce projet, je suis en train de mettre au point des essais de quantification de microARN dans les ovules et les spermatozoïdes de poisson zèbre afin d'étudier leur implication possible dans l'héritage maternel ou paternel d'altérations induites par les contaminants dans la réponse au stress.


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Kenan Tuma - Étudiante de 4e année  2018-2019

Mon projet, supervisé par les Drs Mennigen et Gilmour, est axé sur l'étude des effets de l'axe somatotrope sur les phénotypes métaboliques de la truite arc-en-ciel (Onchorynchus mykiss) dominante et subordonnée. J'utiliserai la truite arc-en-ciel juvénile comme modèle pour déterminer si l'axe GH-IGF est régulé différemment au niveau de l'expression génétique et du niveau de protéines entre la truite arc-en-ciel subordonnée et dominante. Ceci permettra d'améliorer notre compréhension de la contribution de cet axe endocrinien important aux phénotypes métaboliques observés chez la truite arc-en-ciel.



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Christine Hum - Étudiante de 4e année 2018-2019

Mon projet porte sur les conséquences métaboliques du composé fluoré F-53B, un contaminant aquatique récemment découvert dans les systèmes aquatiques chinois dans le développement du poisson zèbre. J'utilise une série d'essais de phénotypage métabolique des larves de poissons zèbres en conjonction avec des approches d'expression génique pour identifier les effets potentiels du F-53B ainsi que des composés fluorés PFOS et OBS à des concentrations correspondant à 10%, 1% et 0,1% des CL50 de chaque composé identifiées.



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Manuela Fonseca - Étudiante UROP 2017-2018

Je participe à l'analyse du comportement de parade nuptiale des poissons zèbres mâles en réponse à l'inhibition pharmacologique de l'isotocine et de la vasotocine des nonapeptides dans le poisson zèbre, qui fait partie du projet de maîtrise en sciences de Zeinab.

Bénévoles

​Nha-Thi Luu
Tess Julian
Georges Coté
​Jon Tea

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